Acervo
O acervo da Instituição é composto de mais de 11 mil objetos, divididos em 29 coleções, como: iconografia (pinturas, gravuras, fotos), indumentária (roupas, acessórios, modas de épocas), armaria (armas), etnologia (objetos relacionados à cultura indígena), escravista (objetos utilizados no período da escravidão), documentos, máquinas, utensílios domésticos, objetos de uso pessoal, missões, dentre outras. O acervo é tombado como patrimônio nacional, pelo Instituto do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional (IPHAN).
Reservas Técnicas
Para abrigar este grande acervo, o Museu faz uso de duas Reservas Técnicas. Ambas possuem sistema de segurança (câmeras de vigilância) e equipamentos de controle de temperatura e umidade. Na Reserva Técnica 1, encontram-se peças de indumentária, armaria, mobiliário e acervo indígena.
Na Reserva Técnica 2, estão acondicionados o acervo fotográfico, jornais e têxteis, materiais que, por suas composições, necessitam de controle rigoroso.
Para a catalogação das peças do museu é utilizado um banco de dados informatizado que é alimentado constantemente com referências de pesquisas de acervo e imagens, permitindo aprimoramento e especialização na busca de peças e informações.